Ja, in Berlin waren sie sogar sechsstellig: die ersten drei Stellen für die Wagentype, die zweiten drei Stellen eine mit 001 beginnende, fortlaufende Nummer innerhalb der jeweiligen Type. Dieses Schema kam m.W. in allen größeren Städten der DDR (u.a. auch Dresden) zur Anwendung.
Die Wagennummern in Berlin und Dresden waren ab 1970 siebenstellig, die ersten sechs Stellen wie du beschreibst, die siebte Stelle war eine Prüfziffer. Dasselbe System wendete auch die DR an, die Wagentypen waren auch unterschiedlich, d.h. eine Type, die es bei der DR gab, gab es nicht noch einmal in Berlin. Die Typennummern begannen auch alle mit einem 2er für Elektrotrieb-/Beiwagen. Meines Wissens waren das aber auch die einzigen zwei Städte mit dieser Systematik, andere große Städte wie Leipzig, Magdeburg oder Halle hatten "klassische" drei- bis vierstellige Wagennummern.